An Introduction to the Study of Gastrotricha, with a Taxonomic Key to Families and Genera of the Group

Gastrotricha is a group of meiofaunal-sized, free-living invertebrates present in all aquatic ecosystems. The phylum includes over 860 species globally, of which 505 nominal species have been recorded in marine sandy sediments; another 355 taxa inhabit the freshwater environments, where they are recurrent members of the periphyton and epibenthos, and, to a lesser degree, of the plankton and interstitial fauna. Gastrotrichs are part of the permanent meiofauna and, in general, they rank among the top five groups for abundance within meiobenthic assemblages. The diversity, abundance, and ubiquity of Gastrotricha allow us to suppose an important role for these animals in aquatic ecosystems; however, ecological studies to prove this idea have been comparatively very few. This is mainly because the small size and transparency of their bodies make gastrotrichs dicult to discover in benthic samples; moreover, their contractility and fragility make their handling and morphological survey of the specimens rather dicult. Here we oer an overview, describe the basic techniques used to study these animals, and provide a key to known genera in an attempt to promote easy identification and to increase the number of researchers who may be interested in conducting studies on this understudied ecological group of microscopic organisms

Informe de la expedición científica CIMAR-COCO-I

El proyecto “Conocimiento y gestión de medios marinos y coralinos del Área de Conservación Marina Isla del Coco” fue financiado por el Fondo Francés para el Medio Ambiente Mundial y la Universidad de Costa Rica. Del 9 al 20 de octubre del 2007 un grupo de científicos del Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología (CIMAR) de la Universidad de Costa Rica, en conjunto con personal de otros centros de investigación realizaron la Expedición CIMAR-COCO-I. Para esta expedición se utilizó el barco de MarViva, MV Phoenix I, con un apoyo excelente de la tripulación. La finalidad de esta expedición fue iniciar los diferentes componentes de campo del proyecto.Fondo Francés para el Medio Ambiente Mundial y la Universidad de Costa RicaUCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Básicas::Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología (CIMAR

Distribución vertical de la epifauna en zonas rocosas de entre mareas, Golfo de Nicoya, Costa Rica

Tesis (licenciatura en biología con énfasis en recursos acuáticos)UCR::Vicerrectoría de Docencia::Ciencias Básicas::Facultad de Ciencias::Escuela de Biologí

beach.fauna.cvs

Data set of Spatial distribution of count data of sandy beach macrofauna Caribbean Coast, Costa Rica. The data is in format .cvs for analysis in R.Methodology: The data are 29 sediment samples and these were collected (September 2006) each 200m in a parallel transect on the low spring tide level in a sandy beach of the Caribbean coast of Costa Rica. The data are counts of individuals of marine invertebrates. The samples were taken with a cylindrical core of 18.86 cm2 to a depth of 15 cm into the sediment. The data are part of the project 808-B4-117 of CIMAR, Universidad de Costa Rica.Universidad de Costa Rica/[808-B4-117]/UCR/Costa RicaInvestigation Assistants Program of the Pacuare Reserve. The Endangered Wildlife TrustCentro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología, CIMARUCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Básicas::Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología (CIMAR

Variación temporal ecológica de playas de arena según diferente nivel de conservación en la zona del Parque Nacional Manuel Antonio, Costa Rica

El documento es un informe de investigación realizada en el Área de Conservación Pacífico Central dentro del Parque Nacional Manuel Antonio (SINAC-ACOPAC-D-RES-015-2020). Es parte del proyecto en desarrollo del Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología (CIMAR, UCR) en el proyecto C0041 "Variación temporal ecológica de playas de arena según diferente nivel de conservación en la zona del Parque Nacional Manuel Antonio, Costa Rica". Se brindan resultados preliminares de cuatro playas de arena en cuanto a su sedimento, pendiente e invertebrados que las habitan.Este proyecto busca generar información ecológica de las poblaciones de invertebrados y los factores ambientales que se dan en las playas arenosas del Parque Nacional Manuel Antonio y playa Espadilla. Se eligió este Parque por ser uno de los más visitados e importantes para el SINAC. De esta forma se llenan vacíos de información de utilidad científica y para la gestión del turismo que visita dichas playas. Como se menciono antes para playas de arena tropicales existe poca información sobre la dinámica temporal y sobre la respuesta ecológica ante disturbios antropogénicos. De esta forma con los resultados del presente estudio se contribuirá en entender mejor la manera en que funcionan las playas de arena tropicales.Universidad de Costa Rica/[808-C0-041]/UCR/Costa RicaUCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Básicas::Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología (CIMAR

Poliquetos asociados a madera en descomposición en el manglar de Térraba, Pacífico Sur, Costa Rica

El análisis de la salinidad durante tres campañas de monitoreo (2002-2004, 2005-2008 y 2011-2012), permite establecer que el sector estuarino del HNTS se divide en una zona norte con una fuerte influencia del Río Grande de Térraba y características de un estuario parcialmente mezclado durante el periodo de caudales bajos (diciembre-abril), mientras que se asemeja a un estuario estratificado de cuña salina durante los caudales intermedios (mayo-agosto) y caudales altos (setiembre-noviembre). La zona central, con una mayor influencia marina, presenta características de un estuario bien mezclado o verticalmente homogéneo, mientras que la zona sur del estuario, bajo la influencia del Río Sierpe, se mantiene parcialmente mezclado a lo largo del año. Los primeros siete kilómetros aguas abajo de Ciudad Cortés presentaron una condición fluvial muy bien definida con salinidades inferiores a 1ups, a partir del kilómetro 14 se observa un incremento gradual de los valores de salinidad hasta 30ups hacia la desembocadura, reflejando una mayor influencia de las mareas en este último tramo (F1,47=2.5, p<0.001). El eventual desarrollo del Proyecto Hidroeléctrico El Diquís podría ocasionar un incremento en el aporte de agua dulce entre un 82 y 66% de los valores mínimos promedio y máximos promedio sobre la zona norte del sector estuarino del HNTS durante el periodo de caudales bajos, lo cual generaría condiciones semejantes a las registradas durante el periodo de caudales intermedios. El monitoreo de las relaciones entre los aspectos físicos-químicos y biológicos es esencial para entendimiento de los posibles cambios en el sector estuarino del HNTS.Este artículo presenta datos sobre los taxones de fauna, con énfasis en poliquetos; hallados en madera en descomposición y sedimentos. El estudio se realizó a través de un gradiente de salinidad dentro de un manglar estuarino de Costa Rica. Se capturaron los organismos destruyendo los leños encontrados en el piso del manglar Térraba. También, se sacó muestras de sedimento con un cilindro plástico. Se encontraron siete filos diferentes en las muestras del sedimento. De los 192 individuos encontrados, 18 eran poliquetos, con nueve familias y 11 especies. Al inspeccionar las muestras de madera en descomposición se encontró 2 564 individuos, distribuidos en cinco filos. Los poliquetos sumaron 429 individuos en ocho familias y 16 especies. Aunque los poliquetos fueron más abundantes en la madera deteriorada, su diversidad fue mayor en las muestras de sedimento. La abundancia de poliquetos en los leños se asoció negativamente con el número de individuos de Mollusca, Hexapoda y Crustacea. Se encontró que el gradiente de salinidad explica en gran medida el cambio en la composición de fauna. La disimilitud en la composición de fauna bentónica hallada en la madera deteriorada y los sedimentos en el manglar de Térraba, indicó que la biodiversidad aumenta al interior del manglar, gracias a la diversidad de micro hábitats. Finalmente varios géneros o especies de poliquetos son nuevos registros para Costa Rica y en general para la Costa Pacífica Centroamericana

Benthic macrofauna found in Sandy beaches from Osa Conservation Area, Puntarenas, Southern Pacific coast of Costa Rica

Se describe la diversidad y composición de especies las playas de arena del Pacífico Sur de Costa Rica. En las playas de arena de la región, se colectó individuos de la infauna por medio de barrenos. Para la zona de entre mareas arenosa el número de especies estrictamente mari-na varió de 5 a 13 taxones, número que es intermedio con los reportados previamente para estos ambientes en Costa Rica. En la zonas de arena, el supralitoral lo dominó el isópodo Cirolana salvadorensis, mientras nereidos y un gusano de la Familia Pisionidae dominaron en el infrali-toral. Otros organismos encontrados en las playas fueron cangrejos del género Uca, cangrejos anomuros (Emerita), galletas de mar (Mellita longifissa) y varios grupos de poliquetos tubícolas permanentes o temporales de la fami-lias Onuphidae, Spionidae, Magelonidae y Glyceridae. Las playas mostraron variación en su fauna atribuible en ciertos casos a la exposición al oleaje, teniendo menos fauna en las playas más reflectivas. Se mencionan acitivades humanas que pueden explicar la baja riqueza de especies encontrada en algunas de las playas analizadas.The diversity and species composition of the intertidal sandy beaches in the southern Pacific coast of Costa Rica were studied by means of cores collected along perpendicular transects to the beaches. The numbers of strictly marine species varied between 5 to 13 taxa, representing an intermediate value compared to those previously reported for these environments in Costa Rica. The isopod Cirolana salva-dorensis was the dominant species in the supralittoral zone, whereas polychaete worms belonging to the families Nereididae and Pisionidae dominated the low intertidal zone. Others organisms collected in the beaches were the crabs of the genus Uca, anomurans crabs (Emerita), sand dollars (Mellita longifissa) and several taxa of poly-chaete tubeworms, such as the Onuphidae, Spionidae, Magelonidae, and Glyceridae. The high faunal difference among the sites is possibly explained by their exposure to the wave energy, with fewer individuals in the more reflective beaches. In addition, human activities might also be responsible for the low infaunal diversity found in some of these beaches. This is the first effort to describe the benthonic fauna of beaches from this area.Fundación Keto/[]//Costa RicaThe Nature Conservancy/[]/TNC/Costa RicaUCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Básicas::Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología (CIMAR)UCR::Vicerrectoría de Docencia::Ciencias Básicas::Facultad de Ciencias::Escuela de Biologí

Comparación temporal de la composición y zonación de organismos en el intermareal rocoso del Parque Nacional Isla del Coco, Pacífico de Costa Rica

La zona entre mareas rocoso de las bahías Chatham y Wafer en la Isla del Coco, Costa Rica fueron muestreadas fotográficamente con cuadrículas de 25x25cm en enero y octubre de 2007. Bahía Chatham también se visitó en abril 2008. El intermareal de Chatham estaba constituido por roca basáltica y en Wafer por basalto y cantos rodados de ignimbrita. Las principales diferencias entre sitios fueron las algas con mayor cobetura (erectas-frondosas) y el mayor número de bandas de organismos se dio en Chatham. No se encontró cambio temporal en la cobertura total de fauna sésil y de autótrofos. La mayor cobertura de invertebrados fue la del cirripedio Tetraclita stalactifera, siempre sobre la banda en la zona inferior de las algas. La diversidad de la fauna móvil no presentó tendencia significativa entre los meses de muestreo. Sin embargo, la identidad de las especies, cobertura o abundancia mostró un cambio temporal moderado. En octubre cuando el agua superficial del mar fue baja (23ºC), el infralitoral tuvo un incremento en la cobertura de las algas verdes. La dominancia en enero y abril fue de algas rojas (incrustantes y erectas-frondosas). Las lapas pulmonadas Siphonaria gigas y las cianobacterias del litoral medio mostraron una asociación negativa. Los caracoles de litoral alto y supralittoral presentaron un cambio temporal en su abundancia pero con diferentes patrones entre los sitios. Un incremento de variación en la composición de organismos se dio desde el supralitoral al infralitoral, posiblemente causado por el cambio en las condiciones del agua y el clima, que influyen en la zona entre mareas durante el alta y bajamar, respectivamente

Basura marina del Golfo de Nicoya, Costa Rica 2021 (Matriz de datos)

This data comes from a study with quantification of marine litter along the Gulf of Nicoya, Costa Rica, during January 2021. The study was carried out by CIMAR, Universidad de Costa Rica and published in Marine Pollution Bulletin (Sibaja-Cordero & Gómez-Ramírez, 2022). A total of fourteen sandy beaches were visited. The sampling was performed above the high tide mark on each beach locality. Marine litter was collected in a transect 3 m wide and 100 m long parallel to the sea to standardize sampling at all 14 beaches. The columns in the matrix are items of marine litter that were collected, separated, counted, and weighed. The first column is the name of the sandy beach; the second column is the general type of marine litter. Column 3 is the category of marine litter in the CIMAR classification; column 4 is the name of the items in the Ospar catalog. Column 5 is the Ospar code. Columns 6 and 7 are the weight and the quantity of marine litter items within the transept, respectively.Estos datos provienen de un estudio sobre cuantificación de basura marina a lo largo del Golfo de Nicoya, Costa Rica, durante enero de 2021. El estudio fue realizado por el CIMAR, Universidad de Costa Rica y publicado en Marine Pollution Bulletin (Sibaja-Cordero & Gómez-Ramírez, 2022). Se visitaron un total de catorce playas de arena. El muestreo se realizó por encima de la marca de la marea alta en cada localidad. La basura marina se recolectó en un transecto de 3 m de ancho y 100 m de largo paralelo al mar para estandarizar el muestreo en las 14 playas. Las columnas de la matriz son elementos de basura marina que se recolectaron, separaron, contaron y pesaron. La primera columna es el nombre de la playa de arena; la segunda columna es el tipo general de basura marina. La columna 3 es la categoría de basura marina en la clasificación CIMAR; la columna 4 es el nombre de los ítems de basura en el catálogo de Ospar. La columna 5 es el código Ospar. Las columnas 6 y 7 son el peso y la cantidad de basura marina dentro del transepto, respectivamente.UCR::Vicerrectoría de Investigación::Unidades de Investigación::Ciencias Básicas::Centro de Investigación en Ciencias del Mar y Limnología (CIMAR

Spatial and temporal variation of rocky intertidal organisms: Bahía Panamá, North Pacific, Costa Rica

The intertidal rocky shore of Bahía Panama, within Bahía Culebra in the North Pacific coast of Costa Rica, was sampled to study the biodiversity and the spatial patterns (three sites with differences in wave exposure, and five strata, from low to high tide levels) and temporal variation (a single date in 2007 and 2013) in different microhabitats (over and under rock surface, and crevices). The epibenthic organisms were sampled with quadrats of 25 x 25 cm in each stratum, and cryptic fauna was accounted by both visual census and manual collecting. The general pattern of vertical zonation of organisms at each site showed an increase in variety toward the infralittoral level, as well as in the composition of assemblages or partially in identity of taxa in each stratum. The sheltered section of the rocky coast, with shallow sand bottom (< 1 m), low wave action and greater sedimentation rate, had lower diversity, cover and abundance that increased towards the wave-exposed section, with more abrupt slope in the edge of rocky platform, lower turbidity, and deeper sand bottom (2-3 m). The horizontal change was more evident in epibenthic organisms, followed by the under rock surface inhabitants and finally in crevices. For the epibenthic organisms, a temporal change in assemblages (cover and abundance) was found between the 2007 and 2013, at each site and level (possibly by seasonal upwelling influence), but the spatial structure (vertical and horizontal) of the rocky shore seems the main cause of change in the composition of species. The spatial pattern of change in the biota (sheltered to exposed gradient) could be expected in similar shores of the Central American Pacific. Finally, the 157 species found (16 autotrophic taxa, 22 fishes, and 119 invertebrates) indicate the high biodiversity of this habitat in the tropics, and the importance of their conservation. Rev. Biol. Trop. 62 (Suppl. 4): 85-97. Epub 2014 Diciembre 01.The intertidal rocky shore of Bahía Panama, within Bahía Culebra in the North Pacific coast of Costa Rica, was sampled to study the biodiversity and the spatial patterns (three sites with differences in wave exposure, and five strata, from low to high tide levels) and temporal variation (a single date in 2007 and 2013) in different microhabitats (over and under rock surface, and crevices). The epibenthic organisms were sampled with quadrats of 25 x 25 cm in each stratum, and cryptic fauna was accounted by both visual census and manual collecting. The general pattern of vertical zonation of organisms at each site showed an increase in variety toward the infralittoral level, as well as in the composition of assemblages or partially in identity of taxa in each stratum. The sheltered section of the rocky coast, with shallow sand bottom (< 1 m), low wave action and greater sedimentation rate, had lower diversity, cover and abundance that increased towards the wave-exposed section, with more abrupt slope in the edge of rocky platform, lower turbidity, and deeper sand bottom (2-3 m). The horizontal change was more evident in epibenthic organisms, followed by the under rock surface inhabitants and finally in crevices. For the epibenthic organisms, a temporal change in assemblages (cover and abundance) was found between the 2007 and 2013, at each site and level (possibly by seasonal upwelling influence), but the spatial structure (vertical and horizontal) of the rocky shore seems the main cause of change in the composition of species. The spatial pattern of change in the biota (sheltered to exposed gradient) could be expected in similar shores of the Central American Pacific. Finally, the 157 species found (16 autotrophic taxa, 22 fishes, and 119 invertebrates) indicate the high biodiversity of this habitat in the tropics, and the importance of their conservation. Rev. Biol. Trop. 62 (Suppl. 4): 85-97. Epub 2014 Diciembre 01